病毒爆发第18天，凌晨3:11，世界已被重塑得面目全非。血藤母树，这株千米级的生物构造体，宛如一座庞大的绿色堡垒，其冠顶正举行着一场意义非凡的生态议会。
类人果实们通过根系紧密相连，进行着思维共享，那庞大的植物神经网络仿佛在编织着一个全新的智慧网络。丧尸代表则展示着珊瑚城的全息投影，海底文明已具雏形，斑斓的珊瑚与游动的丧尸生物构建出一个奇幻而陌生的世界。共生体悬浮舱释放出记忆孢子，其中竟含着恐龙灭绝的真相——一场来自外星文明的实验失控。
不同文明间的碰撞一触即发。人类被要求交出林晓冉腹中的胚胎，以此来换取在这个新秩序中的生存席位。血藤则坚决要求清除所有机械改造体，老吴的怀表装置也在其列。而周小葵，因其助听器能接收宇宙信号，被推举为“声波翻译官”，她的命运就此与这复杂的局势紧紧捆绑。
离开血藤母树，众人的目光被天空中的奇异景象吸引。月球背面突然显现出巨型几何纹路，反光率急剧突变，仿佛在向地球传达着某种未知的信号。外星装置正有条不紊地剥离月壤，内部晶体核心逐渐暴露，与此同时，地球的潮汐锁定导致永昼永夜分割线发生位移，整个世界的昼夜节律被彻底打乱。
面对外星文明的入侵，众人展开技术反制。血藤果实被改造成生物激光发射器，向采矿光束发出反击，试图干扰外星装置的运作。老吴再次发挥他的智慧，改装怀表引发月震，成功释放出冰封在月球的外星探测器。在探索过程中，他们发现月球尘埃中竟含有抗病毒纳米机械，宛如一剂文明疫苗，给人类的未来带来了一丝曙光。
然而，地球的大气环境正急剧恶化。氧气浓度降至12%，全球陷入窒息状态。但危机之下，病毒竟激活了休眠线粒体，使得皮肤呼吸成为可能。血藤也释放出定制化空气包囊，可想要获取，却需用记忆交换。
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